MICAS: Microsatellite Analysis Server

All Non-Coding Repeats of Bradyrhizobium sp. BTAi1 plasmid pBBta01

Total Repeats: 951

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_009475	TGT	2	6	25	30	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_009475	ACA	2	6	37	42	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_009475	GC	3	6	82	87	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_009475	AAC	2	6	99	104	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_009475	TC	3	6	149	154	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_009475	GAAAA	2	10	2474	2483	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
7	NC_009475	A	6	6	2480	2485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_009475	TCG	2	6	2585	2590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_009475	CTC	2	6	4387	4392	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_009475	CAG	2	6	4403	4408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_009475	ACCGCG	2	12	4447	4458	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
12	NC_009475	GGC	2	6	4459	4464	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_009475	TCG	2	6	4501	4506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_009475	CGA	2	6	4530	4535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_009475	TGC	2	6	5123	5128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_009475	CG	3	6	5200	5205	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_009475	CGG	2	6	5209	5214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_009475	GTCG	2	8	5284	5291	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19	NC_009475	TGA	2	6	5416	5421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_009475	TGC	2	6	5461	5466	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_009475	GCC	2	6	5508	5513	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_009475	CCAG	2	8	6122	6129	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_009475	CCG	2	6	6136	6141	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_009475	GATT	2	8	7138	7145	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_009475	CTC	2	6	7148	7153	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
26	NC_009475	CG	4	8	7176	7183	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_009475	TGG	2	6	9678	9683	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_009475	TTC	2	6	9690	9695	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_009475	TCGCT	2	10	9740	9749	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
30	NC_009475	ATGGCT	2	12	9763	9774	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_009475	CCT	2	6	11677	11682	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
32	NC_009475	TGC	2	6	11692	11697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_009475	GC	3	6	11739	11744	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
34	NC_009475	GCA	2	6	11749	11754	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_009475	C	6	6	11772	11777	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
36	NC_009475	AG	3	6	11788	11793	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_009475	GCT	2	6	11801	11806	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_009475	GC	3	6	11850	11855	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_009475	GTG	2	6	11865	11870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_009475	AGCA	2	8	11871	11878	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_009475	ATCG	2	8	11923	11930	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
42	NC_009475	GGCT	2	8	11933	11940	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
43	NC_009475	GCA	2	6	11953	11958	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_009475	GA	3	6	12013	12018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_009475	CGC	2	6	12619	12624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
46	NC_009475	CAT	2	6	13672	13677	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_009475	GTTCGC	2	12	13756	13767	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_009475	GTC	2	6	14064	14069	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_009475	CTT	2	6	14153	14158	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_009475	GGC	2	6	14159	14164	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_009475	CGA	2	6	14170	14175	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_009475	TCC	2	6	14221	14226	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_009475	TGCG	2	8	14290	14297	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
54	NC_009475	CAT	2	6	14299	14304	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_009475	CTGC	2	8	14355	14362	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
56	NC_009475	ACGT	2	8	14442	14449	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_009475	CACCGA	2	12	15426	15437	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
58	NC_009475	CGA	2	6	15440	15445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_009475	GTC	2	6	15477	15482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_009475	CGA	2	6	15544	15549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_009475	CTTT	2	8	18008	18015	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
62	NC_009475	CAG	2	6	18096	18101	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_009475	GC	3	6	26557	26562	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_009475	TAC	2	6	26759	26764	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_009475	CGT	2	6	26824	26829	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_009475	AAGG	2	8	26834	26841	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
67	NC_009475	TCG	2	6	26856	26861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_009475	CAT	2	6	26893	26898	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_009475	GAG	2	6	27034	27039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
70	NC_009475	GCG	2	6	27083	27088	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_009475	AGCG	2	8	27116	27123	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_009475	AT	3	6	27170	27175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_009475	CAA	2	6	27204	27209	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_009475	TAT	2	6	27215	27220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_009475	GCA	2	6	27221	27226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_009475	CCA	2	6	27286	27291	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_009475	TCAG	2	8	27346	27353	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
78	NC_009475	CTT	2	6	27424	27429	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_009475	CTA	2	6	27636	27641	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_009475	AGC	2	6	28724	28729	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_009475	TAGCT	2	10	28841	28850	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
82	NC_009475	TGCAGG	2	12	28910	28921	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_009475	CGA	2	6	28929	28934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_009475	GATTT	2	10	28938	28947	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
85	NC_009475	AAGCCG	2	12	29573	29584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_009475	AAG	2	6	29656	29661	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
87	NC_009475	TGA	2	6	29703	29708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_009475	CTCG	2	8	29870	29877	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_009475	CGA	2	6	29888	29893	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_009475	CGG	2	6	29991	29996	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_009475	GCA	2	6	30027	30032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_009475	GCG	2	6	30059	30064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_009475	AGA	2	6	30079	30084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_009475	GTC	2	6	30167	30172	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_009475	CAT	2	6	30242	30247	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_009475	ACG	2	6	30257	30262	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_009475	ATC	2	6	30349	30354	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_009475	GCT	2	6	30379	30384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_009475	GA	3	6	30393	30398	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_009475	CGG	2	6	30793	30798	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_009475	GTT	2	6	31641	31646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
102	NC_009475	CGG	2	6	31717	31722	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_009475	CTT	2	6	31732	31737	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_009475	CGC	2	6	31749	31754	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_009475	CCG	2	6	31802	31807	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
106	NC_009475	AGGAAT	2	12	31814	31825	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_009475	CAA	2	6	31829	31834	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_009475	ATGG	2	8	32814	32821	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_009475	CGG	2	6	38208	38213	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_009475	CGG	2	6	38233	38238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_009475	GC	3	6	38279	38284	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_009475	C	6	6	38309	38314	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
113	NC_009475	AGC	2	6	38330	38335	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_009475	GC	3	6	41563	41568	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_009475	ACGC	2	8	41570	41577	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
116	NC_009475	CG	4	8	41598	41605	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_009475	AGGAC	2	10	41638	41647	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
118	NC_009475	CGG	2	6	42058	42063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_009475	TCC	2	6	42073	42078	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_009475	CG	4	8	42107	42114	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_009475	AC	3	6	42117	42122	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
122	NC_009475	GCCG	2	8	46806	46813	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_009475	GAT	2	6	47395	47400	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_009475	ATGG	2	8	48036	48043	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_009475	GCAC	2	8	48106	48113	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
126	NC_009475	AGG	2	6	48399	48404	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
127	NC_009475	CGT	2	6	49093	49098	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_009475	CGGCGC	2	12	49153	49164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_009475	TCG	2	6	50141	50146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_009475	CGC	2	6	50202	50207	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_009475	CGTT	2	8	50208	50215	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_009475	TCG	2	6	50433	50438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_009475	CGA	2	6	50440	50445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_009475	CCG	2	6	50464	50469	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_009475	GCT	2	6	50503	50508	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_009475	GGC	2	6	50527	50532	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_009475	GCCT	2	8	50571	50578	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_009475	CGG	2	6	50596	50601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_009475	CGG	2	6	50979	50984	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
140	NC_009475	TCC	2	6	50993	50998	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
141	NC_009475	GA	3	6	51011	51016	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_009475	GCG	2	6	51678	51683	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
143	NC_009475	CCCT	2	8	52136	52143	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
144	NC_009475	CGA	2	6	54063	54068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
145	NC_009475	CTGC	2	8	54078	54085	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
146	NC_009475	GGC	2	6	54113	54118	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
147	NC_009475	GC	3	6	54134	54139	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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149	NC_009475	GC	3	6	59939	59944	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_009475	AGGCG	2	10	59954	59963	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
151	NC_009475	AT	3	6	60037	60042	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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155	NC_009475	CAG	2	6	60245	60250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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181	NC_009475	CGC	2	6	62205	62210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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280	NC_009475	TCG	2	6	83971	83976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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282	NC_009475	TGAC	2	8	84129	84136	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
283	NC_009475	TGT	2	6	84167	84172	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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423	NC_009475	CGG	2	6	113556	113561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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456	NC_009475	CGC	2	6	115189	115194	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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462	NC_009475	GC	3	6	115367	115372	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
463	NC_009475	GAG	2	6	116804	116809	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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465	NC_009475	GCC	2	6	116839	116844	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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